偃甲门首领庄琴为夺取“机械心,”将天机门灭门,打却未能找到“机械心”的下落。二十年后,庄琴决定以重金为饵,号召民众提供“机械心”的线索。主角叁池醉心于发明创造,对偃甲门很是崇拜。他本想去找“机械心”,却被迫随义父九叔到陆家村打井。叁池偶然间发现了鲁家的后人洛儿在村内守护着“机械心”的秘密。叁池几番周折后,得到了“机械心”。庄琴率领偃甲门人袭击陆家村,叁池将“机械心”交给庄琴希望换取村民的平安,庄琴得到“机械心”后,却命令门下对村民痛下杀手。九叔变身九面匠人出战,阻止了偃甲门的袭击,却打坏了“机械心。”庄琴卷土重来,带来了神秘高手,重伤了九叔,陆家村危在旦夕,所有人的命运都担负在叁池的身上,身无缚鸡之力的叁池,将如何逆转乾坤……
在这个城市的高处、在一间大公寓内,居住着一对夫妻。他们非常相爱。女的是一个画家,男的是一个成功的演员。这是一个平凡无奇的下午——或者说不平凡的下午,因为明天凌晨的4点44分,地球将遭遇一场无法预计的灾难。没有预警、没有通知、没有办法逃生,当然,更不可能有生还者。在地球毁灭前的这天下午,这对夫妻过着和往常一样的生活,无忧无虑。其实,不仅仅是他们,全世界的所有人已经接受了地球行将毁灭,生命即将告终的命运。
园田真理、菊池启太郎的侄子条太郎、海堂直也与不知何时回来的草加雅人,一同经营着“菊池西洋洗涤铺”,同时也为俄尔以诺提供庇护。 而由政府重组的智脑公司已转变为一家旨在消灭俄尔以诺的公司,由北崎领导。 某天,为拯救被追杀的俄尔以诺,草加与海堂变身为假面骑士凯撒和蛇俄尔以诺,与消灭俄尔以诺小队的队长胡桃玲菜交战。 在那里出现了消失数年、下落不明的乾巧。乾巧变身为全新形态——假面骑士次世代555(暂译),作为智脑公司阵营的头部战力,与真理等人对战。 遭到攻击的真理等人都对此感到不解。乾巧为何会出现在智脑公司?失踪至今都在做些什么…… 这一戏剧性的重逢,拉开了俄尔以诺与人类故事的新篇章……